Probabilmente, anzi sicuramante, dirò una sciocchezza, ma io ho avuto un'esperienza simile con una Royal Enfield Bullet 500 (non ridete

).
Avevo abbassato il manubrio per caricare di più l'anteriore e sopra una certa velocità incominciava a serpeggiare.
Posto che la tua moto e la Bullet hanno in comune solo il numero di ruote, alla fine era venuto fuori che quella misera variazione di assetto mandava in crisi l'equilibrio fra anteriore e posteriore.
Se toglievo precarico al posteriore la moto si sedeva (ripristinando quindi di fatto la situazione di partenza) e non faceva più quell'effetto.