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18 bmw, 3 RT... Chapeau!!!
Inutile dirti quello che già sai: no, non è normale che perda colpi, né da fredda né mai.
Le cause possono essere molte, tutte connesse al sistema di alimentazione e accensione: sensori di Hall, (bobine, le metto tra parentesi perché te ne hanno cambiata una, ma quale? una delle principali o la secondaria? sarà una delle altre? sarebbe bene capire se perde da un cilindro, e da quale, o da entrambi) candele (in che stato sono? leggendole si dovrebbe capire quale è il cilndro matto) cavi di alta e bassa tensione delle candele. Poi: benzina sporca o annacquata, filtro benzina intasato, pompa che funziona a singhiozzo, iniettore sporco/difettoso...
Credo che se riesci a smontare le candele quando ti fa il problema si possa ridurre il ventaglio di possibilità. Indicativamente: candela imbrattata o nera, -> accensione, quindi parte elettrica, candela asciutta -> momentanea mancanza di benzina (quindi da verificare l'alimentazione)