Può darsi ci siano delle bolle d'aria ferme in qualche punto critico (tipo qualche curva del tubo) che non si riescano a spurgare normalmente. A me successe una volta con il 125.
Prima di cambiare la pompa prova a ripetere lo spurgo staccando la pinza dal fodero della forcella (ovviamente metti uno spessore fra le due pastiglie) e stendendo il tubo del freno.
Ciao