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un relè anche se lo colleghi al contrario non gli succede nulla, anche se uno dei due dovrebbe avere un diodo ma è fatto per circuti a 12V quindi non vedo problemi.
Da quello che hai descritto, hai messo in corto cicuito due batterie tra di loro, l'impianto della moto era in quel momento in parallelo a questo corto circuito e non dovrebbe essere stato interessato da nessuno shock elettrico...