[pino59]

propendo per la seconda ipotesi,
più di una volta abbiamo soccorso amici rimasti a secco, dopo il rifornimento moto ripartite senza alcun problema,
il punto di pescaggio della pompa (non è realmente sul fondo del serbatoio) è sempre lo stesso sia a serbatoio pieno che vuoto, se ci fosse della morchia la pescherebbe lo stesso indipendentemente dal livello di benzina, ma ci sono i filtri prima e dopo la pompa e sugli iniettori per cui escluderei questa come causa del problema.